关于DNA序列在NCBI上比对的问题1.我做细菌鉴定,把16srDNA PCR后拿出去测序,得到了两条序列,一条正的,一条反的,在比对以前是要把它整合成一条链吗?怎样整合?2.请大概说一下,我想知道是什么菌,

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/30 23:06:47
关于DNA序列在NCBI上比对的问题1.我做细菌鉴定,把16srDNA PCR后拿出去测序,得到了两条序列,一条正的,一条反的,在比对以前是要把它整合成一条链吗?怎样整合?2.请大概说一下,我想知道是什么菌,
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关于DNA序列在NCBI上比对的问题1.我做细菌鉴定,把16srDNA PCR后拿出去测序,得到了两条序列,一条正的,一条反的,在比对以前是要把它整合成一条链吗?怎样整合?2.请大概说一下,我想知道是什么菌,
关于DNA序列在NCBI上比对的问题
1.我做细菌鉴定,把16srDNA PCR后拿出去测序,得到了两条序列,一条正的,一条反的,在比对以前是要把它整合成一条链吗?怎样整合?
2.请大概说一下,我想知道是什么菌,应该怎样使用NCBI,越详细越好.

关于DNA序列在NCBI上比对的问题1.我做细菌鉴定,把16srDNA PCR后拿出去测序,得到了两条序列,一条正的,一条反的,在比对以前是要把它整合成一条链吗?怎样整合?2.请大概说一下,我想知道是什么菌,
正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了.
把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看这些完全配对的序列出自什么菌种(不能有两个菌种的序列和你的序列相同,如果相同,那么就不能作为鉴定菌种的特征序列了),并且查阅提交这个序列的相关文献.得到进一步的信息.
我说的步骤,只要你认真看NCBI的网页,你自己应该是可以操作下去的.

同意楼上,测序都测过了,让你老板教教你!

= =
如果你嫌麻烦,序列发给我,我帮你做好了。
如果你想知道具体的,我嫌打字麻烦 - -|||
而且,专业鉴定是不直接上NCBI对比的,你只是想知道是什么菌的话也根本不用测两端,测一端就够了。

动物dna序列为什么在ncbi上比对完和植物的该基因相似 关于DNA序列在NCBI上比对的问题1.我做细菌鉴定,把16srDNA PCR后拿出去测序,得到了两条序列,一条正的,一条反的,在比对以前是要把它整合成一条链吗?怎样整合?2.请大概说一下,我想知道是什么菌, 关于种属鉴定、NCBI的BLAST比对和DNAMAN同源性分析的问题测得某DNA样本基因序列是ACCGCCTGCCCAGTGACACATGTTTAACGGCCGCGGTACCCTAACCGTGCAAAGGTAGCATAATCACTTGTTCCTTAAATAGGGACCTGTATGAATGGCTCCACGAGGGTTCAGCTGTCTCTTACTTTTAACCAGTGAAATTGAC 关于已知DNA序列在NCBI上比对并鉴定菌种1.我做细菌鉴定,把16srDNA PCR后拿出去双向测序,得到了两条序列,一条正的,一条反的,在比对以前是要把它整合成一条链吗?怎样整合?如何鉴定.两条链如下 怎样在NCBI上查找棉铃虫类胰蛋白酶的DNA序列 我把在NCBI上比对结果为99%的序列,拿来和我的序列再用DNAMAN比对一下,发现相似度只有30%了,为什么呢?我有一段序列,在NCBI上比对之后,找到一段相似度99%的序列,然后手动将这两段序列用DNAMAN比 在NCBI氨基酸序列比对中,specific/nonspecific ncbi上的blast序列比对工具怎么使用,求具体操作指南. 如何在NCBI上寻找要扩增的序列?我要用PRIMER 设计引物.位点是CYP2C19*2,是一个SNP的位点.我在NCBI里查到了这个基因的信息.现在我有3个问题如下:1.引物设计的对象是FASTA中的序列还是GENEBANK中的 OMPA的基因序列是什么?怎么在NCBI上查? 怎样能将DNA序列从反向换算成正向?我测序结果想放到NCBI上BLAST比对,可是得到的是反向序列,可以直接比对么?如果要转换成正向序列,用什么软件?我分少 还是非常感谢了.回1楼的:我转换成正 NCBI的blastn 引物比对与ACCESSION的问题碱基序列tcgccgaaagagttagcannnnnnnnnaatccatccctgtcggtg(实为一对引物的合并序列)在NCBI的blastn中,与ACCESSION:AY070235 (Align two or more sequences)可100%匹配,见图参数选 NCBI使用问题.我是初学者,想知道用NCBI怎么查dna、rna的全部序列啊?知道的亲请快速回复,着急ing.... 关于NCBI(在线等谢谢)请问怎么样从NCBI上找出某个多肽序列的全长cDNA序列的标识编号? NCBI Blast 中的黑色、蓝色、绿色、粉色和红色都是什么意思?在 NCBI 中进行核酸序列比对,比对结果的 Graphic Summary 中会有黑色、蓝色、绿色、粉色和红色的代表一些数值的标记, 怎么在NCBI上比对其他基因? 在NCBI上怎么查找某一基因在不同种属中已公布的同源序列 blast检验引物特异性NCBI上没有我所要物种的某基因序列,设计引物时我用人的序列做模版,想问下还有没有blast比对的意义,如果有该怎样去比对呢,