得到菌株的16SrDNA序列后,怎么鉴定菌株的分类地位?我从土壤中分离出来一些细菌,要鉴定它们是什么种,并最后构建系统发育树.我把这些菌株制备了菌液,并做了16SrDNA的扩增,现在得到了序列.拿

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/20 03:38:10
得到菌株的16SrDNA序列后,怎么鉴定菌株的分类地位?我从土壤中分离出来一些细菌,要鉴定它们是什么种,并最后构建系统发育树.我把这些菌株制备了菌液,并做了16SrDNA的扩增,现在得到了序列.拿
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得到菌株的16SrDNA序列后,怎么鉴定菌株的分类地位?我从土壤中分离出来一些细菌,要鉴定它们是什么种,并最后构建系统发育树.我把这些菌株制备了菌液,并做了16SrDNA的扩增,现在得到了序列.拿
得到菌株的16SrDNA序列后,怎么鉴定菌株的分类地位?
我从土壤中分离出来一些细菌,要鉴定它们是什么种,并最后构建系统发育树.我把这些菌株制备了菌液,并做了16SrDNA的扩增,现在得到了序列.拿去NCBI比对时,发现NCBI上有一个是nucleotide blast,还有一个是blastx.我进前者比对时,经常是说找不到搜索结果.我用后者比对时,每次都有结果,但是我不知道覆盖率和匹配率要达到多少,才能说我的菌株就是那个种?就是说,在blastx里面,我不知道比对的标准.刚开始我每次都只看匹配率,认为只要匹配率在98%以上可以了,后来别人告诉我这样的方法是错的.得到菌株的16SrDNA序列后,到底应该怎么比对才能将菌株鉴定到种?

得到菌株的16SrDNA序列后,怎么鉴定菌株的分类地位?我从土壤中分离出来一些细菌,要鉴定它们是什么种,并最后构建系统发育树.我把这些菌株制备了菌液,并做了16SrDNA的扩增,现在得到了序列.拿
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得到菌株的16SrDNA序列后,怎么鉴定菌株的分类地位?我从土壤中分离出来一些细菌,要鉴定它们是什么种,并最后构建系统发育树.我把这些菌株制备了菌液,并做了16SrDNA的扩增,现在得到了序列.拿 测出来的序列里找不到pcr 引物序列我用16srdna鉴定细菌,拼出来的序列里面找不到PCR引物序列,有没有可能会影响结果.这个序列到底是不是鉴定菌的序列啊 怎样在genebank查找16SrDNA序列我想设计16SrDNA的引物,但是找不到16SrDNA的序列,genebank中都是16SrRNA的序列,我是新手, 关于已知DNA序列在NCBI上比对并鉴定菌种1.我做细菌鉴定,把16srDNA PCR后拿出去双向测序,得到了两条序列,一条正的,一条反的,在比对以前是要把它整合成一条链吗?怎样整合?如何鉴定.两条链如下 请问细菌16SRDNA 测序,测出来的序列里面找不到引物,序列还可靠吗?我做了细菌16SRDNA 测序,但是测序后拼接引物后找不到引物,测出来的序列是对的吗 “分离得到一株具木聚糖酶活性的放线菌菌株pp2,该菌株具有典型链霉菌属的形态学特征.通过对其进行形态学、生理生化特性以及16S rRNA基因序列等方面的分类学研究,菌株pp2初步鉴定为链霉 16SrDNA与16SrRNA的区别在NCBI上找一细菌的16SrDNA序列,用来做同源性分析,查到的都是16SrRNA序列信息,该怎么操作啊?请教在NCBI上同源性分析的具体步骤,着急, 关于DNA序列在NCBI上比对的问题1.我做细菌鉴定,把16srDNA PCR后拿出去测序,得到了两条序列,一条正的,一条反的,在比对以前是要把它整合成一条链吗?怎样整合?2.请大概说一下,我想知道是什么菌, 什么是 16SrDNA (rRNA)序列分析谢谢~! 16SrDNA测序后在ncbi上比对细菌鉴定,16SrDNApcr扩增测序之后用blast比对,出来一个相似度99%的菌种,怎样体现数据库也是用16SrDNA序列跟我做的序列匹配的呢?换句话说,我想知道这99%相似度是不是我 您说的这个引物是所有细菌的都可以用?还是用于肠杆菌科的?还是用于芽孢杆菌的?有可以鉴定所有细菌16SrDNA的全长序列吗? 细菌如何提取16srDNA(用来做种类鉴定的) 有了16SrDNA的序列,构建系统发育树要怎么做啊?从土壤中分离了大量的解磷细菌,测得了16SrDNA的序列.想知道其分类地位,看我的土样中到底都是些什么属种的解磷细菌.因为量比较多,没法一个一 请问申请菌株的专利之前要做什么准备工作?怎么把菌株送去做鉴定保藏? 细菌16S rDNA 序列比对,菌种鉴定中,已测出待定菌种的16SrDNA序列.那么:1、在NCBI上比对时,有三个属的多个已知菌种与新菌匹配率都95%以上,值最高的那个属其实真的在预料之外,而且文献中也没 PCR扩增16sRNA怎么扩?我有几株菌,想初步对其进行种属的鉴定.我拿到的材料上要求分别提基因组DNA后,用PCR扩增其16sRNA,.怎么扩?我看到文献上都是扩16SrDNA的步骤,但没有扩16sRNA的步骤.本人菜鸟, 细菌现在已经16SrDNA鉴定到了属,其中有几个的比对的同源性100%.其他的我需要鉴定到种怎么办?呵呵 16srDNA 测出的两条序列都要比对吗?详细最好了(整个鉴定流程)!我是新手是的,我是两条链都测序,就是生工所谓的“测通”。现在就是不知道怎样拼接,因为我两条分别去blast结果有很大的