什么是 16SrDNA (rRNA)序列分析谢谢~!

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/19 02:49:22
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16SrDAN是编码原核生物核糖体小亚基rRNA(16SrRNA)的基因.
长度约为1500pb,是细菌分类学研究中最常用、最有用的“分子钟”,其序列包含10个可变区(variable region)和与之相同的11个恒定区(constant region),可变区因细菌而异,且变异程度与细菌的系统发育密切相关[1-3],Trand等通过对27株原核生物16SrDNA的比对发现其中至少在9个高度保守的寡聚体(oligomers);较之23SrDNA等看家基因而异,它具有分子大小适中,突变率小等优点,素有“细菌化石”之称[2,4].Woese等[3]与Olsen等[4]基于对16SrDNA的分析构建了现已被分认的全生命系统进化树,越来越多的细菌依据16SrDNA被正确分类或重分类,尤其是许多环境中的细菌[5.6],如Funke等将棒杆菌依赖细胞毒性1组及类似棒杆菌重新确定为放线菌的一个新种,即钮氏放线菌中,Bennasar等通过比较14株施氏假单胞菌的7基因型(DNA-DNA杂交同源组),发现SP1402T(T为模式株)和SL401与施氏假单胞菌模式株明显不同,从而命名为一个新种称巴利阿里假单胞菌(Pseudomonas balearica)[2];有的研究者还根据种内菌株间的RFLP而将各菌分为不同的核酸型(ribotype,RT)[7].
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由于16SrDNA 在进化过程中十分保守,具有相对一定的进化速率,因此常用于进化分析

什么是 16SrDNA (rRNA)序列分析谢谢~! 请问什么是16SrDNA? 怎样在genebank查找16SrDNA序列我想设计16SrDNA的引物,但是找不到16SrDNA的序列,genebank中都是16SrRNA的序列,我是新手, 什么是16S rRNA基因序列分析法鉴定病原细菌 如何知道细菌的16s rRNA的完整序列 16S rRNA怎样进行序列分析比对 16srdna测序需要向测序公司提供序列外还要提供什么吗? 18S rRNA和18SrDNA有什么区别?小核糖体RNA (18S rRNA)基因就是18SrDNA么? 请问细菌16SRDNA 测序,测出来的序列里面找不到引物,序列还可靠吗?我做了细菌16SRDNA 测序,但是测序后拼接引物后找不到引物,测出来的序列是对的吗 测出来的序列里找不到pcr 引物序列我用16srdna鉴定细菌,拼出来的序列里面找不到PCR引物序列,有没有可能会影响结果.这个序列到底是不是鉴定菌的序列啊 16SrDNA与16SrRNA的区别在NCBI上找一细菌的16SrDNA序列,用来做同源性分析,查到的都是16SrRNA序列信息,该怎么操作啊?请教在NCBI上同源性分析的具体步骤,着急, 生物:什么是rRNA?详细! Query Sbjct什么意思 在基因序列里16S rRNA基因序列分析结果 以Query开头 是什么意思 真菌染色体上是否有编码rRNA相对应的DNA序列 比如像16s rRNA基因是细菌染色体上编码rRNA相对应的DNA序列这样的呢? 16S rRNA 的几个可变区分别在序列的什么位置? 16SrDNA怎样转化成16SrRNA我的序列是16srdna的,ncbi上都是16srrna,需要转换过来吗?可以直接拿来就blast么 S rDNA基因的V3区引物与16SrDNA 基因序列的扩增采用细菌通用引物之间有什么区别呢? 生物学中为什么要把16S rRNA碱基序列作为鉴定生物之间是否有亲属关系的依据