如何查某个基因位点的功能?知道某基因的单核苷酸多态性位点,如:rs怎么可以查到它他能具有的生物学功能知道某基因的单核苷酸多态性位点,如:rs779805 ,怎么可以查到它可能具有的生物学
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/07/18 18:40:28
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如何查某个基因位点的功能?知道某基因的单核苷酸多态性位点,如:rs怎么可以查到它他能具有的生物学功能
知道某基因的单核苷酸多态性位点,如:rs779805 ,怎么可以查到它可能具有的生物学功能
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去NCBI上找搜rs779805,后面的框里选择SNP,出来的结果里有一排东西,就是SNP序列下面的那一排东西,那一排东西有一个PUBMED的选项,点开那个,如果有文章,那就是针对这个SNP位点的研究文章,你可以从文章中发该位点的功能.
另外你也可以去SNPedia这个网站看看,不过这个网站的内容不是很全,而且是网友自己编的,内容不权威.
如果该基因在基因CDS区域,主要还是考察该基因编码的蛋白质生物活性,将CDS区域翻译成对应的蛋白质,对照读码框,对应单核苷酸多态位点编码的蛋白质,可以看到氨基酸的改变,这是基于一级结构的变化,而至于该氨基酸的变化会引起蛋白质生物活性怎样的变化则要看该氨基酸所处的区域位置,如果氨基酸处于进化保守区,以及功能域附近或者就是用来结合辅酶的活性位点,那么这种改变有可能导致蛋白质活性的丧失,而如果位于离功能...
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如果该基因在基因CDS区域,主要还是考察该基因编码的蛋白质生物活性,将CDS区域翻译成对应的蛋白质,对照读码框,对应单核苷酸多态位点编码的蛋白质,可以看到氨基酸的改变,这是基于一级结构的变化,而至于该氨基酸的变化会引起蛋白质生物活性怎样的变化则要看该氨基酸所处的区域位置,如果氨基酸处于进化保守区,以及功能域附近或者就是用来结合辅酶的活性位点,那么这种改变有可能导致蛋白质活性的丧失,而如果位于离功能域较远的位点,则有可能影响很小或者不影响功能(但一定会影响蛋白质空间结构),往小了说只是改变了蛋白活性,但往大了说,如果该蛋白是某些基因的阻遏调控因子,那么这种改变很有可能导致某些在已分化时期失去活力的基因重新表达,引发疾病的产生。
而如果位于基因区的内含子区,则有可能造成真核基因剪接信号的改变,导致内含子以隐外显子的方式出现在真核RNA身上,编码出无活性的蛋白质,
针对trna还有稀有密码子等等一些修饰上的特殊情况。
某F的浅见批评指教
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对不起,无此网络资源。。。