如何在NCBI中查基因密码子偏好性

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/06 00:45:41
如何在NCBI中查基因密码子偏好性
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如何在NCBI中查基因密码子偏好性
如何在NCBI中查基因密码子偏好性

如何在NCBI中查基因密码子偏好性
NCBI没有这样的数据,你可以在CodonUsageDatabase查到相关物种的密码子偏好信息.
CodonUsageDatabase数据库用以计算密码子偏好的序列数据都是来自NCBI,也是学术界和工业界经常使用的数据库.该数据库是用物种名索引的.使用之前必须首先搞清楚你所研究物种的拉丁名(例如 Homo sapiens).也可按字母浏览.不过在检索方式上,该数据库不象其他的生物信息学数据库那么灵活,其对检索词要求比较严格.可能的原因是有些物种的拉丁名非常相似(例如只差一个数字),如果出差错的话,就是“差之毫厘 谬以千里”.因此,反复核对物种名应该是使用该数据库最重要的步骤.