基因芯片热图怎么看?

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/17 16:52:38
基因芯片热图怎么看?
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基因芯片热图怎么看?
基因芯片热图怎么看?

基因芯片热图怎么看?
我不是很熟悉,简单说两句抛砖引玉一下.
1.左侧的文本应该是基因编号,热图的每一行代表一个基因(或mRNA?).
2.下方的文本应该是样本编号,热图的每一列代表一个样本.
3.上方的树状结构代表样本之间的相似度聚落关系.比如从左往右,一,二号样本的模式最为相近,三,四之间也互相类似.如果打比方,一二是亲兄弟,三四是亲姐妹,这四个全是一个家里面的孩子,五是他们的表姐.而六七八要再隔一辈,是爷爷的兄弟(伯公)的孙子辈.再往右,大家的亲缘关系就比较远了,左边8个样本和右边11个样本分为两组,相互之间有显著差异.
4.右边的树状结构代表基因之间的相似度聚落关系.道理类似以上.结果相似的基因,很有可能在染色体上面位置相近,也有可能是受到相同transcription factor调控而表达的mRNA.