求助保守序列查找,引物设计最近老师给了一个基因,只知道名称,让我们自己摸索,设计引物,做克隆.菜鸟一只,完全不知怎么做,希望有前辈帮帮忙,给个指导,

来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/11/20 03:26:37
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求助保守序列查找,引物设计
最近老师给了一个基因,只知道名称,让我们自己摸索,设计引物,做克隆.菜鸟一只,完全不知怎么做,希望有前辈帮帮忙,给个指导,

求助保守序列查找,引物设计最近老师给了一个基因,只知道名称,让我们自己摸索,设计引物,做克隆.菜鸟一只,完全不知怎么做,希望有前辈帮帮忙,给个指导,
如果：你研究的物种没有这个基因,就可以按下面步骤做.
1：把你的基因名称粘贴在NCBI的蛋白质数据库中,进行搜索（这个比核酸数据库更保守一些）
2：根据搜索到的结果,看下面列出的信息,有没有和你研究物种是近缘的（从分类上说的）
3：下载10-20条左右的氨基酸序列（片段长度最好差不多、下载最好分布多个近缘物种）
4：保存成FASTA格式,用MEGA软件（或其他可对比软件）,进行比对
5：根据比对结果,找到保守序列（例如MEGA的显示是小星号,这个自己看一下软件就OK啦）
6：根据保守序列,按照简并引物设计原则,设计成对引物.（这个要学习一下如何从氨基酸翻译成核苷酸）
7：将序列给公司,进行合成.
8：回来,进行普通PCR扩增,如果有目的条带,则进行割胶回收,连接载体,克隆,测序
9：将测序结果进行BLASTX比对,看扩增的是否是你的基因,可用于全长扩增等后续实验
如果：你研究的物种有这个基因,就直接根据数据库中的序列设计引物就行啦.

求助保守序列查找,引物设计最近老师给了一个基因,只知道名称,让我们自己摸索,设计引物,做克隆.菜鸟一只,完全不知怎么做,希望有前辈帮帮忙,给个指导, 特异引物PCR问题各位大牛,小弟初涉分子生物实验,最近在用设计好的特异性引物扩增保守序列,可是总也是扩增不出来,常常是只有引物二聚体,没有任何扩增条带,我也试着在引物报告单上所给 设计引物的时候,我比对氨基酸序列,由于保守性很高,老师让我用核苷酸序列比对.我比对氨基酸序列,由于保守性及较高,老师让我用核苷酸序列比对.直接用核苷酸序列设计引物,由于核苷酸长 如何读基因序列,设计引物时的保守区指那一段序列 PCR引物设计中的问题、保守序列在目的基因内、但是引物为什么在保守序列设计?设计引物为什么一定要在保守序列内设计?保守序列在ORF内,在保守序列内设计引物怎么得到能够完整表达的核 试根据一段序列设计一对pcr引物,并在两端加上两个限制性酶切位点这是老师给的考试题库，题目就是这个了。 若给一指定DNA序列并需要通过PCR扩增此序列,如何设计扩增引物? 怎么查找猪P66Shc基因序列?最好有过程和结果,（pcr引物设计用） 设计引物如何选择序列 加拿大哥伦比亚大学设计并公布的ISSR引物序列,能不能给我一份儿啊!谢谢! toutou1986@163.com 怎样查找基因序列RS号我要做基因多态性,知道SNP位点,设计引物需要序列RS号,请问怎样去查找 GKVVLIVNLAT DIRWNFEKFLI是我经蛋白质比对后选取的两个保守序列 怎么进行简并引物的设计 全序列为malhedkriplseysgkvvlivnlatyglnfqyhelnvlqetfpedfvitgfpcnqfalqepaangtelidglmhvrpgngfepnfrlfgkvevngenetplysylkescpstmdefmrsemlhya 怎样在genebank查找16SrDNA序列我想设计16SrDNA的引物,但是找不到16SrDNA的序列,genebank中都是16SrRNA的序列,我是新手, 关于引物设计要对目的基因进行定量分析,基因全长1932NT,是不是只要选择其中的一段就行了,长约400NT左右,那么这一段应如何选?该基因的保守序列吗?该怎么确定一段基因是否是保守序列?我在G 引物设计区域选择问题.我设计兼并引物.多序列比对发现三个保守区.一个在中上游,一个在中游,一个在下游.有经验的朋友能告诉我我该选哪个保守区设计引物吗?设计多少对比较好?用来扩增 给出dna序列怎么设计引物 如何设计已知序列的引物 RT-PCR的引物如何设计?本人刚接触RT-PCR,需要从其它几个物种基因的保守序列中,设计出另一个物种这个基因RT-PCR引物,但是实在是一头雾水,