SWISS MODEL建立三维结构,系统自动出来的三维结构进一步修饰问题还有系统生成的三维结构,怎么进行验证它对不对?或按照你的方法系统自动生成的三维结构后,怎么进一步进行修饰?

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/07/08 13:53:27
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SWISS MODEL建立三维结构,系统自动出来的三维结构进一步修饰问题
还有系统生成的三维结构,怎么进行验证它对不对?或按照你的方法系统自动生成的三维结构后,怎么进一步进行修饰?

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我只粗略学过一点生物信息的知识,我觉得可以用不同的分析软件来处理下看看有无明显差异,而且一般库里(PDB)有的都是别人解过的,你研究的要是新的蛋白或是库里没有可以找专门解结构的实验室.

修饰的话我觉得可以用软件.从库里把文件下下来,用软件分析会比较方便个人喜好,

我比较推荐Pymol (http://pymol.sourceforge.net/)

(希望你能找到免费的),可以选择显示不同的亚基或是形式(棍棒的,球棍的,卡通的,表面方式看个位点,还有可以滤掉一些水和侧链的,额,反正大概是这样)

算下原子间间距或是显示活性位点的分布等也是可以的.

还可以涂个色等等.