比较概述基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学的概念、研究方法、优缺点及应用设想

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/07/07 02:43:38
比较概述基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学的概念、研究方法、优缺点及应用设想
xUnF 0 @?h>#qWʶ(Q7""-%ұ,K(K|/tV#j ]̙sΌNWV ?WZqo#[+ϯlj:X_ӫl^bK)/3Q] U]y;AYjG;O?a}>Ħ~<%Gۗ^0FB(`͂xC`#d87EߖVFL)Y,ܖ]+OjTE-uUP3bI' $/g*je$oo6SQ]\ t,q&'ǖ8!Cg?>,MQ0<< a,Qmkr;"taU{ϘJ,!@.B%_Tm5F7BoA!=D_-,S?Aʿ{Rbcu,yr)1BZ&coz'[J+Y 4& (TZլ7:;2'`EiH6טpzZrrz36ᎈ 4 izb`|~k( I%f_ek(y-D_8|YB-:vEC{Au:`Pj#ǰʉ?f ]fU]!{b܅;qhh So&f@a " ΥͪA!gc{O`(pqruGM%=Bk&]4`qvd_mC@>F4W ^YY2l6 &;Y0Al+k5 Ê>v U%gEeicM%-BUᆺgeGN~ v

比较概述基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学的概念、研究方法、优缺点及应用设想
比较概述基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学的概念、研究方法、优缺点及应用设想

比较概述基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学的概念、研究方法、优缺点及应用设想
组学omics,研究的是整体.按照分析目标不同主要分为基因组学,转录组学,蛋白质组学,代谢组学.
基因组学研究的主要是基因组DNA,使用方法目前以二代测序为主,将基因组拆成小片段后再用生物信息学算法进行迭代组装.当然这仅仅是第一步,随后还有繁琐的基因注释等数据分析工作.
转录组学研究的是某个时间点的mRNA总和,可以用芯片,也可以用测序.芯片是用已知的基因探针,测序则有可能发现新的mRNA,
蛋白组学针对的是全体蛋白,组要以2D-Gel和质谱为主,分为top-down和bottom-up分析方法.理念和基因组类似,将蛋白用特定的物料化学手段分解成小肽段,在通过质量反推蛋白序列,最后进行搜索,标识已知未知的蛋白序列.
代谢组分析的代谢产物,是大分子和小分子的混合物,主要也是用液相和质谱.
总而言之,这些技术都想从全局找变量,都是一种top-down的研究方法,原因很简单:避免‘只缘身在此山中’的尴尬.
但因为技术局限,都各有缺点,尤其是转录组和蛋白组数据,基本上颠覆了以前一直认为的mRNA水平能代表蛋白水平的观念,因为这两组数据的重合度太低.
所以目前很多研究都开始使用交叉验证方法.
无论如何,都需要对数据进行分析,有经验的分析往往能化腐朽为神奇.