用mega做进化树事错误提示:No common nucleotide sites如题!关于下面的参数,看了帮助文件后,我已经把Gaps/Missing Date的选项改成Pairwise Deletion了,这样的话,显示树会做一部分,但是没有结果.在Model里面

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/15 22:54:16
用mega做进化树事错误提示:No common nucleotide sites如题!关于下面的参数,看了帮助文件后,我已经把Gaps/Missing Date的选项改成Pairwise Deletion了,这样的话,显示树会做一部分,但是没有结果.在Model里面
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用mega做进化树事错误提示:No common nucleotide sites如题!关于下面的参数,看了帮助文件后,我已经把Gaps/Missing Date的选项改成Pairwise Deletion了,这样的话,显示树会做一部分,但是没有结果.在Model里面
用mega做进化树事错误提示:No common nucleotide sites
如题!关于下面的参数,看了帮助文件后,我已经把Gaps/Missing Date的选项改成Pairwise Deletion了,这样的话,显示树会做一部分,但是没有结果.在Model里面的各种模型也试用了一遍,还是做不出来,感激不尽!

用mega做进化树事错误提示:No common nucleotide sites如题!关于下面的参数,看了帮助文件后,我已经把Gaps/Missing Date的选项改成Pairwise Deletion了,这样的话,显示树会做一部分,但是没有结果.在Model里面
如果你的序列里面有gaps,那么你是否设置了gaps symbols(也就是问号、空格之类的),序列里面如果有gaps就要用那些符号代替.发现gaps并用这些符号代替的目的是为了保证不同序列长度的一致.
如果你没有设置gaps,也就是说,序列有长有短.当你选择了Pairwise Deletion的时候,根据其原理,都有某个碱基缺失的序列和没有该碱基位点缺失的序列在计算时会被分为两组,也就是你的分析里模型参数要根据不同的数据集进行估计,这样很容易出现算不下去的问题.
由于不知道你的数据集到底是如何处理的,你检查下我上面说的看看,首先要设置gaps符号,最后校对下gaps的使序列有同样的长度,毕竟我们的序列往往都是测序中出现的,一般数目很少.然后不用选Pairwise Deletion.

应该是序列差别太大,根本就没同源性可言
把相差太大的序列去掉再重新做树看看
我以前也碰到这种情况,随便拿几条来试的话就会
是要有同源性的序列来比对才可以的吧

用mega做进化树事错误提示:No common nucleotide sites如题!关于下面的参数,看了帮助文件后,我已经把Gaps/Missing Date的选项改成Pairwise Deletion了,这样的话,显示树会做一部分,但是没有结果.在Model里面 用mega软件做出来的进化树的比例尺表示什么意思 谁能帮我做一个分子进化树和下面这样的序列比对的图我下的mega死活不会用啊我可以提供序列信息 进化树分支的数字什么意思?请问我用MEGA 4.1 构建的进化树分支数值大部分都是0,1,5等很小的数值,1.2.为什么我的数值都是那么小? MEGA MEGA. 用mega做出来了系统发育树,该怎样分析?RT 我用mega 对一系列的序列进行了 发育树的构建..但是 构建过后该怎样对其分析 ,该分析些什么呢?求教. 如何用mega分析进化树,..如图所示的进化树,麻烦大虾们能不能帮我分析一下啊..急用啊 如何做进化树 谢谢..那么MEGA或者clustalx可否对不同序列长度的序列做比对?我找出的同一种酶在不同物种中的序列,可长度不等..这样是否也能比较同源性?做进化树就可以吗? 应用MEGA构建进化树时是否需要把目的基因序列与同源基因的序列一起转化为FASTA格式,保存一个文件?我是MEGA软件初级使用者,现在想建一个目的基因的系统进化树,想请教大家在建树时要将同 怎么样用MEGA软件分析DNA序列 用MEGA 如何计算GC含量 生物进化树怎么做 三角波变方波电路查找错误提示错误说是:no model specified for U4:A 用催化剂处理汽车尾气中的CO和NO:CO+NO–C+NO2 2.0 mega 12.1 mega .